MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA03

Total Repeats: 2700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009431	GC	3	6	447	452	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
2	NC_009431	GCGCG	2	10	505	514	0 %	0 %	60 %	40 %	146280243
3	NC_009431	GCA	2	6	531	536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280243
4	NC_009431	GCAACG	2	12	600	611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280243
5	NC_009431	CGC	2	6	669	674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
6	NC_009431	GCG	2	6	693	698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
7	NC_009431	GGC	2	6	703	708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
8	NC_009431	CGA	2	6	709	714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280243
9	NC_009431	CG	3	6	736	741	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
10	NC_009431	G	6	6	790	795	0 %	0 %	100 %	0 %	146280243
11	NC_009431	GGC	2	6	822	827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
12	NC_009431	CGGG	2	8	831	838	0 %	0 %	75 %	25 %	146280243
13	NC_009431	CTCGG	2	10	869	878	0 %	20 %	40 %	40 %	146280243
14	NC_009431	GGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280243
15	NC_009431	CGC	2	6	901	906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
16	NC_009431	CCGG	2	8	1031	1038	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
17	NC_009431	GCC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
18	NC_009431	CGGC	2	8	1128	1135	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
19	NC_009431	GCC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
20	NC_009431	CGG	2	6	1183	1188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
21	NC_009431	ACC	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280243
22	NC_009431	CCGC	2	8	1227	1234	0 %	0 %	25 %	75 %	146280243
23	NC_009431	CACCGT	3	18	1396	1413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146280243
24	NC_009431	GGCG	2	8	1426	1433	0 %	0 %	75 %	25 %	146280243
25	NC_009431	GCGCC	2	10	1475	1484	0 %	0 %	40 %	60 %	146280243
26	NC_009431	CG	3	6	1501	1506	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
27	NC_009431	TCG	2	6	1638	1643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280243
28	NC_009431	CGGG	2	8	1658	1665	0 %	0 %	75 %	25 %	146280243
29	NC_009431	GC	3	6	1669	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
30	NC_009431	TCGGC	2	10	1728	1737	0 %	20 %	40 %	40 %	146280243
31	NC_009431	CCT	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280243
32	NC_009431	TCG	2	6	1788	1793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280243
33	NC_009431	GTG	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280243
34	NC_009431	CGG	2	6	1852	1857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
35	NC_009431	CGG	2	6	1875	1880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
36	NC_009431	CGC	2	6	1960	1965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
37	NC_009431	GGT	2	6	2056	2061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280243
38	NC_009431	GC	3	6	2093	2098	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
39	NC_009431	GCC	2	6	2115	2120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
40	NC_009431	GCC	2	6	2125	2130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
41	NC_009431	GC	3	6	2165	2170	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
42	NC_009431	GATGC	2	10	2180	2189	20 %	20 %	40 %	20 %	146280243
43	NC_009431	GCCC	2	8	2200	2207	0 %	0 %	25 %	75 %	146280243
44	NC_009431	GC	3	6	2214	2219	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
45	NC_009431	GC	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
46	NC_009431	CGC	3	9	2272	2280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
47	NC_009431	GCC	2	6	2284	2289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
48	NC_009431	GCA	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280243
49	NC_009431	CGC	2	6	2325	2330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
50	NC_009431	CCGCC	2	10	2331	2340	0 %	0 %	20 %	80 %	146280243
51	NC_009431	GCC	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
52	NC_009431	CGGG	2	8	2358	2365	0 %	0 %	75 %	25 %	146280243
53	NC_009431	CCG	2	6	2366	2371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
54	NC_009431	GCC	2	6	2372	2377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
55	NC_009431	CCG	2	6	2382	2387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
56	NC_009431	GCA	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280243
57	NC_009431	GCC	3	9	2483	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
58	NC_009431	GCC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
59	NC_009431	CCG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
60	NC_009431	AGG	2	6	2622	2627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280243
61	NC_009431	GCC	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
62	NC_009431	GC	3	6	2670	2675	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
63	NC_009431	CGAC	2	8	2679	2686	25 %	0 %	25 %	50 %	146280243
64	NC_009431	AGC	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280243
65	NC_009431	GGTCT	2	10	2732	2741	0 %	40 %	40 %	20 %	146280243
66	NC_009431	GC	3	6	2850	2855	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
67	NC_009431	CAGC	2	8	2893	2900	25 %	0 %	25 %	50 %	146280243
68	NC_009431	GCG	2	6	2904	2909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
69	NC_009431	ACC	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280243
70	NC_009431	CGG	2	6	3076	3081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
71	NC_009431	AAC	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280243
72	NC_009431	AGGCC	2	10	3213	3222	20 %	0 %	40 %	40 %	146280243
73	NC_009431	GAA	2	6	3250	3255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280243
74	NC_009431	CGACG	2	10	3271	3280	20 %	0 %	40 %	40 %	146280243
75	NC_009431	GAG	2	6	3371	3376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280243
76	NC_009431	CGG	2	6	3420	3425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
77	NC_009431	CG	3	6	3477	3482	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
78	NC_009431	CGC	2	6	3501	3506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
79	NC_009431	GCC	2	6	3527	3532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280243
80	NC_009431	GGC	2	6	3562	3567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
81	NC_009431	TGC	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280243
82	NC_009431	ATC	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280243
83	NC_009431	GGA	2	6	3604	3609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280243
84	NC_009431	GCCG	2	8	3673	3680	0 %	0 %	50 %	50 %	146280243
85	NC_009431	ATC	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280243
86	NC_009431	GGC	2	6	3716	3721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280243
87	NC_009431	CCT	2	6	4332	4337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280244
88	NC_009431	GTC	2	6	4379	4384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280244
89	NC_009431	CCG	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280244
90	NC_009431	CCA	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280244
91	NC_009431	GGC	2	6	4429	4434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280244
92	NC_009431	GCCGT	2	10	4449	4458	0 %	20 %	40 %	40 %	146280244
93	NC_009431	ACGG	2	8	4477	4484	25 %	0 %	50 %	25 %	146280244
94	NC_009431	CGT	2	6	4656	4661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280244
95	NC_009431	TCT	2	6	4689	4694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280244
96	NC_009431	GCCC	2	8	4698	4705	0 %	0 %	25 %	75 %	146280244
97	NC_009431	GGC	2	6	4717	4722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280244
98	NC_009431	GA	3	6	4733	4738	50 %	0 %	50 %	0 %	146280244
99	NC_009431	CCG	2	6	4761	4766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280244
100	NC_009431	CGAAGG	2	12	4803	4814	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146280244
101	NC_009431	TCC	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280244
102	NC_009431	CAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280244
103	NC_009431	CCT	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280244
104	NC_009431	ACG	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280244
105	NC_009431	GCC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280244
106	NC_009431	GCG	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280245
107	NC_009431	GGC	2	6	5278	5283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280245
108	NC_009431	GTC	2	6	5303	5308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
109	NC_009431	TGC	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
110	NC_009431	CTG	2	6	5431	5436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
111	NC_009431	TTC	2	6	5498	5503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280245
112	NC_009431	GTC	2	6	5556	5561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
113	NC_009431	TGC	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
114	NC_009431	GCT	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
115	NC_009431	CTG	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
116	NC_009431	CG	3	6	5626	5631	0 %	0 %	50 %	50 %	146280245
117	NC_009431	GCGGTC	2	12	5709	5720	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146280245
118	NC_009431	GA	3	6	5736	5741	50 %	0 %	50 %	0 %	146280245
119	NC_009431	CGG	2	6	5758	5763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280245
120	NC_009431	GGTC	2	8	5869	5876	0 %	25 %	50 %	25 %	146280245
121	NC_009431	GAC	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280245
122	NC_009431	CCG	2	6	5947	5952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280245
123	NC_009431	GC	4	8	5961	5968	0 %	0 %	50 %	50 %	146280245
124	NC_009431	GCC	2	6	6036	6041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280245
125	NC_009431	GC	3	6	6091	6096	0 %	0 %	50 %	50 %	146280245
126	NC_009431	TTC	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280245
127	NC_009431	CTG	2	6	6149	6154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
128	NC_009431	ACC	2	6	6177	6182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280245
129	NC_009431	GTT	2	6	6206	6211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280245
130	NC_009431	CAG	2	6	6218	6223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280245
131	NC_009431	TCG	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280245
132	NC_009431	CACG	2	8	6316	6323	25 %	0 %	25 %	50 %	146280245
133	NC_009431	CAG	2	6	6386	6391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280245
134	NC_009431	GCC	2	6	6450	6455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280245
135	NC_009431	AGG	2	6	6477	6482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280245
136	NC_009431	CCG	2	6	6540	6545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280245
137	NC_009431	GCG	2	6	6573	6578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280245
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144	NC_009431	GGCGAG	2	12	6923	6934	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	146280245
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149	NC_009431	CCAGG	2	10	8277	8286	20 %	0 %	40 %	40 %	146280246
150	NC_009431	GCCCGC	2	12	8295	8306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280246
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163	NC_009431	CGA	2	6	8702	8707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280246
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257	NC_009431	CATGC	2	10	12702	12711	20 %	20 %	20 %	40 %	146280250
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259	NC_009431	GCC	2	6	12757	12762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280250
260	NC_009431	TGCCGA	2	12	12763	12774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146280250
261	NC_009431	ATCTCG	2	12	12784	12795	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146280250
262	NC_009431	CG	3	6	12826	12831	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
263	NC_009431	GC	3	6	12863	12868	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
264	NC_009431	GCCG	2	8	12969	12976	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
265	NC_009431	GAT	2	6	12986	12991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280250
266	NC_009431	CGG	2	6	13087	13092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280250
267	NC_009431	GGT	2	6	13136	13141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280250
268	NC_009431	TCG	2	6	13147	13152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280250
269	NC_009431	TGG	2	6	13174	13179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280250
270	NC_009431	GAG	2	6	13182	13187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280250
271	NC_009431	GC	5	10	13188	13197	0 %	0 %	50 %	50 %	146280250
272	NC_009431	CCG	2	6	13237	13242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280250
273	NC_009431	TGG	2	6	13243	13248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280250
274	NC_009431	GCTGGC	2	12	13253	13264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146280250
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279	NC_009431	CG	3	6	13779	13784	0 %	0 %	50 %	50 %	146280251
280	NC_009431	GCC	2	6	13809	13814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280251
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282	NC_009431	GTG	2	6	14189	14194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280252
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287	NC_009431	CG	3	6	14373	14378	0 %	0 %	50 %	50 %	146280252
288	NC_009431	GGA	2	6	14407	14412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280252
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293	NC_009431	CGG	2	6	14575	14580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280252
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296	NC_009431	CG	3	6	14907	14912	0 %	0 %	50 %	50 %	146280253
297	NC_009431	GGC	2	6	14938	14943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280253
298	NC_009431	CGG	2	6	14956	14961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280253
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300	NC_009431	GGA	2	6	15022	15027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280253
301	NC_009431	GCG	2	6	15108	15113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280253
302	NC_009431	GA	3	6	15144	15149	50 %	0 %	50 %	0 %	146280253
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348	NC_009431	CCG	2	6	17454	17459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280256
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384	NC_009431	GGCGT	2	10	20259	20268	0 %	20 %	60 %	20 %	146280259
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386	NC_009431	CTT	2	6	20446	20451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280260
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389	NC_009431	GC	3	6	20588	20593	0 %	0 %	50 %	50 %	146280260
390	NC_009431	GCG	2	6	20632	20637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280260
391	NC_009431	G	6	6	20706	20711	0 %	0 %	100 %	0 %	146280260
392	NC_009431	TCG	2	6	20716	20721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280260
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394	NC_009431	CGC	2	6	20859	20864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280260
395	NC_009431	CGA	2	6	20880	20885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280260
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500	NC_009431	CGC	2	6	24716	24721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280264

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